Sejarah Desa Bojong dimulai ketika Lurah I yang diketahui masyarakat yaitu sejak tahun 1960 yang dijabat oleh RH Chabibulloh dengan Carik dijabat oleh H Dalhar Ichsan dan Kamituo dijabat oleh Amat Daris. R chabibulloh menjabat Lurah Bojong selama 28 tahun yaitu mulai tahun 1960 sampai dengan 1988. Pada awalnya dusun / keperabotan hanya terdiri dari 13 dusun/perabot, pada waktu itu kojor masih menjadi dusun administratif. Selama kepemimpinannya program / kegiatan yang terelaisasi antara lain :
1. Tahun 1960 diadakan kelompok belajar / PBH bagi orang tua termasuk beberapa kadus belum bisa baca tulis.
2. Tahun 1964 dibentuk Lembaga Swadaya Desa ( LSD ) dan di tingkat dusun dibentuk Lembaga Swadaya Kampung ( LSK )
3. Tahun 1964 didirikan gedung SDN Bojong meskipun konstruksinya masih sederhana yaitu dari bambu apus sampai molonya. Dari organisasi – organisasi ada yang menyumbang kursi, meja dan lain – lain.
4. Tahun 1965 karena meletusnya G 30 S PKI di dusun – dusun para pejuang masuk dalam Persatuan Garuda Pancasila sebagai Dantonnya Bp. Abdul Karim.
5. Tahun 1970 Bojong mendapat penghargaan sebagai Desa Teladan nomor I se Kecamatan Mungkid.
6. Tahun 1971 mengikuti lomba PKK tingkat Propinsi dan mendapat hadiah sound sistem/speaker, siarannya masuk RRI Pusat Jakarta.
7. Tahun 1974 Bojong dijadikan tempat untuk shooting film Ateng Minta Kawin selama kurang lebih 3 bulan.
8. Tahun 1978 terbentuk Lembaga Ketahanan Masyarakat Desa ( LKMD ) dengan Ketua Bp. Muh Jarir Karanggondang dan Sekretaris Bapak Kabul Sumedi Kojor.
9. Tahun 1982 pembangunan jalan dari Kojor sampai kali Kunjang.
10. Tahun 1983 : Listrik masuk desa Bojong, Gubernur Suparjo Rustam meresmikan bendungan di Sungai Pabelan, setiap tanggal 17 Agustus mulai diadakan lomba dusun.
11. Tahun 1985 Desa Bojong menang Lomba Desa tingkat karisidenan Kedu mewakili Kabupaten Magelang namun hanya meraih nomor II kalah dari Karanganyar Solo.
12. Tahun 1986 Lomba dusun tingkat kecamatan Mungkid, dusun Kojor memperoleh juara I.
13. Tahun 1988 RH Chabibulloh lengser kemudian diangkat Pj dari Kecamatan yaitu Bp. Arif Priyadi ( Mantri Polisi Mungkid pada waktu itu ).
Pada Tahun 1988 diadakan pemilihan kepala desa dengan calon :
1. Bapak Abdul Djalil ( Kapolsek Mungkid )
2. Bapak Drs. Bambang Supriyo ( Guru SMPN II Magelang ), dengan panitia :
1. Ketua : Bp. R Abdul Karim
2. Sekretaris : Bp. Kabul Sumedi, dengan perolehan suara :
1. Bp. Abdul Jalil mendapat sekitar 1300 suara
2. Bp Drs. Bambang Supriyo mendapat sekitar 900 suara
Bapak H Abdul Djalil menjabat sebagai Kepala Desa Bojong selama 10 tahun yaitu dari tahun 1988 sampai dengan tahun 1998. Adapun program / egiatan yang terlaksana antara lain :
1. Pengaspalan jalan dari Palbapang sampai Gondowangi ( Proyek Kabupaten )
2. Pembentukan LKMD dengan Ketua Bapak Kabul Sumedi
3. Pembangunan Gedung Polindes di Jarakan dengan dana swadaya murni.
4. Bantuan Desa / Bandes setiap tahun yang digunakan untuk membangun sarana dan prasarana desa atau dusun.
5. Program UED SP
6. Pengerasan Jalan dari Bali Desa s/d Purwosari
7. Bidan Desa
8. PAM masuk desa Bojong
9. Pembangunan Gedung Pertemuan Desa
Pada tahun 1998 Bp. H Abdul Djalil lengser dan Pj dijabat oleh Bp. Basir Solisa dari kecamatan Mungkid. Pada tahun itu juga diadakan pemilihan kepala desa dengan calon :
1. Bp. Ahsan Chabib dari Legoksari
2. Bp. Eko Nugroho, SP dari Dendengan
3. Bp. Heri Suprapto, S.Ag dari Dendengan
Yang menjadi pemenang atau terpilih sebagai Kepala Desa adalah Bp. Eko Nugroho. Bp. Eko Nugroho menjabat Kepala Desa Bojong selama 8 tahun yaitu muali tahun 1999 s/d 2007. Selama kepemimpinannya program atau kegiatan yang dilaksanakan antara lain :
1. Pembangunan bendungan kali Kuning di Dukuhan sampai dengan Pasar Ikan Bojong
2. Pembangunan jalan di setiap dusun baik aspal, paving maupun pengerasan.
3. Telepon masuk dusun Meduro, Gadingan, Dendengan, Kojor, Bojong Wetan.
4. Membuat lapangan Desa Bojong di Ngosit.
5. Rehap kantor / ruang pelayanan di kantor desa, mensertifikatkan kantor desa.
6. Juara II lomba ketahanan pangan masyarakat tingkat propinsi Jawa Tengah.
7. Pengaspalan jalan dari Kantor NU, Dukuhan sampai Balai Desa melalui program PKPS BBM
8. Program rehab rumah Keluarga miskin setiap tahun 4 dusun.
Pada tahun 2007 masa jabatan kepala desa habis, dan pada tahun itu juga dilaksanakan pemilihan Kepala Desa dengan calon 3 orang yaitu :
1. Bp. Drs. Aris Siswanto dari Kalangan
2. Bp. Sukaemi Widodo dari Karanggeneng Jarakan
3. Bp. Muh Daim dari Kalangagung
4. Bp. Nurkhasan Abdurohman dari dendengan
Yang menjadi pemenang atau terpilih sebagai Kepala Desa Bojong periode 2007 – 2013 adalah Bp. Drs. Aris Siswanto yang sampai saat ini masih menjabat. Adapaun program atau kegiatan yang telah dilaksanakan antara lain :
1. Pembangunan atau Rehab Kantor Desa atau Balai Desa
2. Pembangunan atau Rehab Musholla Kantor Desa Bojong
3. Tugunisasi setiap dusun
4. Program pensertipikatan tanah dengan biaya murah melalui program SMS ( Sertipikasi Massal Swadya ) bekerja sama dengan BPN Magelang. Telah dilaksanakan 3 kali yaitu tahun 2007, 2008 dan 2010 dengan peserta kurang lebih 950 orang.
5. Mengadakan program meeting setiap hari Senin bagi perangkat desa.
6. Pembangunan atau sheet aspal dari dusun Purwosari sampai dengan Kali Kunjang melalui program bantuan Gubernur
7. Program Simpan Pinjam Perempuan melalui PNPM Mandiri.
8. Juara Harapan I lomba Desa tingkat Kabupaten Magelang.
9. Juara I Lomba PKK tingkat Kabupaten Magelang.
10. Pada tahun 2010 untuk pertama kali sejak tahun 1988 desa Bojong Lunas PBB awal yaitu di bulan Mei 2010 dan mendapat penghargaan dari Bapak Bupati Magelang.
11. Mendirikan Koperasi Desa “Dian Sewu“.
12. Membangun Tanggul Jalan Dusun Dukuhan melalui program daerah bawahan.
13. Membangun gorong –gorong di perempatan Balai Desa.
14. Mengadakan lomba Bulu Tangkis tingkat Desa Bojong di Meduro.
15. Mendirikan Taman Bacaan Masyarakat di dusun Kalangagung.
16. Juara I Taman Bacaan Masyarakat tingkat Kabupaten.
17. Mengadakan program senam sehat untuk perangkat desa setiap hari Jum’at pagi.
18. Perencanaan pembangunan Kios Sentra Industri Sapu di dusun Keprekan.
Pada tahun 2013 jabatan kepala desa Drs.Aris Siswanto berakhir, dan pada bulan Desember 2013 dilaksanakan pemilihan kepala desa Bojong. Dimana peserta calon kepala desa ada dua kandidat yaitu Bapak Drs.Aris Siswanto,Alamat Kalangan Bojong dan Bapak Sukaemi Widodo yang berlalamat di Jarakan Bojong.